خانه مظفر یکی از منحصر به فرد ترین منازل مسکونی دوره قاجار می باشد ، که در محله خلف باغ واقع شده ، ساختمان این بنا که 950 متر مربع مساحت دارد در سال 1266 (1888میلادی) به دستور مظفر که تاجر بلند آوازه ای بود بنا گردید این خانه که در حال حاضر رستوران هتل میباشد دارای بخشهای مختلفی نظیر اتاق پنج دری ، اتاق سه دری ، اتاق دالان ، تالار و زیرزمین است که جهت مهمان خانه ، خیاط خانه ، اتاق خدمه ، اتاق ویژه مظفر و استراحتگاه اهل خانه در ایام تابستان استفاده می شده . هر اتاق دارای فضای کوچکی بنام بالاخانه ، جهت نگهداری اشیا با ارزش و یک انباری می باشد ، معماری این ساختمان در نوع خود بی نظیر می باشد و از مصالح خشت و گل استفاده شده است .

بازسازی و مرمت رستوران (باغ مظفر) در سال 1385 به اتمام رسید . هتل مظفر نیز که دارای قدمت 180 ساله است ، مربوط به مظفر عرب می باشد . که در اردیبهشت 1388 کار مرمت آن شروع و بعد از 10 ماه کار و تلاش شبانه روزی در پایان اسفند ماه 1388 به بهره برداری رسید . افتتاحیه هتل سنتی مظفر با حظور ریاست محترم میراث فرهنگی ، صنایع دستی و گردشگری استان یزد و استاندار و فرماندار یزد در روز چهارشنبه 5/3/1389 رسما برگذار گردید .